Bioinformatiker - Datenverarbeitung & Workflow-Automation

Wir suchen zur Verstärkung unseres Partners einen motivierten und lernfreudigen Bioinformatiker, der Passion für präzise Datenverarbeitung und moderne Technologien mitbringt.

In dieser Rolle entwickeln und optimierst du komplexe Datenverarbeitungs-Workflows – von der Datenaufbereitung über Analyse bis zur Integration in bestehende Systeme. Du arbeitest eng mit verschiedenen Fachabteilungen zusammen und tragen von Anfang an eigenverantwortlich zur kontinuierlichen Verbesserung bei. Dies ist eine Gelegenheit, sich als Bioinformatiker in einem professionellen Umfeld zu entwickeln und direkten Impact auf operative Prozesse zu haben.

• Workflow-Entwicklung & Optimierung: Entwicklung, Validierung, Wartung und Fehlerbehebung von Datenverarbeitungs-Workflows – von Datenaufbereitung und Analyse bis zur Qualitätskontrolle und Datenübertragung
• Automatisierung: Automatisierung und Optimierung reproduzierbarer Prozesse mithilfe von Skripten, Workflow-Managementsystemen und containerisierten Umgebungen
• Datenmanagement & Monitoring: Entwicklung und Pflege von Datenbanken, Qualitätskennzahlen und Monitoring-Tools für Prozessleistung, Workflows und Metadaten
• Schnittstellen & Tools: Weiterentwicklung von Anwendungen und Benutzeroberflächen für den einfachen Zugriff auf Verarbeitungsdaten und Qualitätskennzahlen
• Systemintegration: Integration und Optimierung von Workflows in bestehende Systeme sowie Sicherstellung des nahtlosen Datenaustauschs zwischen verschiedenen Anwendungen und Plattformen in enger interdisziplinärer Zusammenarbeit

Nice-to-Have

• Praktische Erfahrung mit SQL, Workflow-Management-Systemen, oder HPC-Umgebungen
• Erfahrung mit Datenverarbeitungs- und Analyse-Tools
• Erfahrung mit Java oder Groovy
• Kenntnis von Docker oder Singularity
• Verständnis für regulierte Umgebungen und Qualitätsmanagementsysteme
• Erste Erfahrungen mit fortgeschrittener Datenverarbeitung in professionellen Kontexten

• Masterabschluss in Bioinformatik, Informatik, Computational Biology oder verwandtem Fachgebiet (oder gleichwertige praktische Erfahrung)
• Gute praktische Kenntnisse in Python, Linux und Shell-Scripting
• Solides Verständnis von Datenverarbeitungs-Pipelines und Workflow-Engineering
• Strukturierte, zuverlässige und selbstständige Arbeitsweise
• Freude an komplexen technischen Fragestellungen
• Gute Kommunikations- und Teamfähigkeit
• Fliessend Deutsch und Englisch (mindestens B2)

• Flexible Arbeitszeiten und die Möglichkeit zum HOme Office (wo die Funktion dies zulässt)
• 25–32 Ferientage sowie die Möglichkeit, zusätzliche Ferientage zu erwerben
• 13. Monatslohn
• 42-Stunden-Woche
• Grosszügige Unterstützung bei Top Aus und Weiterbildungen
• Attraktive Sozialleistungen und ein umfassendes Gesundheitsmanagement
• Vergünstigungen in den Bereichen Verpflegung, Sport, Freizeit und Mobilität
• Ein kollegiales Umfeld mit kurzen Entscheidungswegen und viel Eigenverantwortung
• Langfristige Entwicklungsmöglichkeiten in einem grossen und stabilen Unternehmen

Nächste Schritte

Interessiert? Einfach bewerben inclusive deiner relevantesten Projekte und Erfahrungen in der klinischen Bioinformatik.

Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung!